212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2473 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
153 aa  311  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  42.31 
 
 
238 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  43.75 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 
231 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.65 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  39.32 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  33.59 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.87 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  38.46 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  34.43 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  35.07 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  39.01 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  40.52 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  39.34 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  36.36 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  39.66 
 
 
134 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  39.66 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  39.66 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.06 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  32.06 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.59 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  35.29 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  34.38 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.5 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.9 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.48 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  38.33 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  33.08 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  33.61 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.76 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  32.03 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  34.4 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  28.21 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  35 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  33.04 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  31.97 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  38.66 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  29.79 
 
 
255 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  30.63 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  29.55 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.69 
 
 
229 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  32.26 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  30.65 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  30.09 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  29.46 
 
 
240 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  29.46 
 
 
240 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  29.46 
 
 
240 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  34.45 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.56 
 
 
232 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
172 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  27.34 
 
 
242 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.34 
 
 
248 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.91 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.09 
 
 
228 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  30.25 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  31.3 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.93 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  29.6 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  28.7 
 
 
232 aa  58.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  27.59 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  29.13 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  34.4 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.17 
 
 
226 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  26.36 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  29.41 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  28.18 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  29.41 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  31.15 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.73 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  29.41 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.38 
 
 
238 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>