More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2152 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2152  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 403 aa  815    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.04 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.929902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  30.22 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.43 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  27.74 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  27.52 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  32.22 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 390 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  28.94 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 523 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  26.97 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  24.24 
 
 		 546 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.48 
 
 		 538 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  32.09 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  32.09 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  26.05 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 540 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  26.83 
 
 		 484 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 568 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  27.06 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  26.11 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 538 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 545 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  28.85 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  28.85 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  30.04 
 
 		 513 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 537 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.34 
 
 		 510 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 503 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  29.41 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 510 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.9 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 402 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 552 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.67 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  29.32 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.14 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 683 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  25.25 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  29.94 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  29.17 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 502 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 507 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 545 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  23.69 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  23.56 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  24.16 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  32.83 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>