More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5532 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 		 368 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  62.88 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.16 
 
 		 361 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.71 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.43 
 
 		 361 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.43 
 
 		 361 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.41 
 
 		 357 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.13 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.64 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.38 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.03 
 
 		 356 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.97 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  31.86 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  27.73 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.47 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 328 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  25.9 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.6 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.63 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  34.62 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  34.21 
 
 		 299 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  24.85 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 		 300 aa  90.1  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  25.75 
 
 		 326 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  26.22 
 
 		 327 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.7 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  36.31 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  33.55 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.74 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.25 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.33 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 311 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.87 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.85 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  26.98 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  24.61 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.45 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.15 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.33 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  25.96 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  31.79 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  25.37 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.52 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.78 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  31.76 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  32.4 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  26.15 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.65 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  31.95 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  30.86 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.3 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.85 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  22.29 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.79 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  31.25 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  26.05 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.15 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  30.25 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  33.76 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.95 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.21 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  28.49 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.56 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>