More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1722 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
357 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2917  outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1274  porin  61.39 
 
 
359 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.688217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2236  porin  60.56 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3041  outer membrane porin  61.39 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  37.63 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  40.93 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  37.63 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  36.64 
 
 
389 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  40 
 
 
387 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  36.75 
 
 
393 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  36.9 
 
 
387 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  37.53 
 
 
385 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  37.19 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  35.31 
 
 
398 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  36.8 
 
 
386 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  33.24 
 
 
379 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  36.08 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  35.52 
 
 
391 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3144  porin  38.46 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  34.96 
 
 
381 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  36.46 
 
 
354 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  38.54 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  35.52 
 
 
387 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  34.24 
 
 
381 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  35.16 
 
 
378 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  35.34 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  37.99 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  34.13 
 
 
361 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.77 
 
 
384 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  36.98 
 
 
358 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.68 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.68 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  37.42 
 
 
355 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  38.91 
 
 
368 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.96 
 
 
371 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.41 
 
 
355 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  35.77 
 
 
377 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  37.78 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  35.17 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  37.72 
 
 
367 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  37.65 
 
 
353 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.15 
 
 
363 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.15 
 
 
363 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.15 
 
 
363 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  39.46 
 
 
374 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.7 
 
 
363 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.15 
 
 
363 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.52 
 
 
367 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.15 
 
 
363 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  36.59 
 
 
350 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.42 
 
 
449 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  35.23 
 
 
353 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  36.69 
 
 
354 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  35.13 
 
 
392 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 
363 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  36.55 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  37.21 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.54 
 
 
363 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.75 
 
 
402 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  34.05 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.07 
 
 
363 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  37.21 
 
 
386 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  36.81 
 
 
379 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  33.86 
 
 
363 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  34.18 
 
 
363 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  34.18 
 
 
363 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  34.18 
 
 
363 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  34.13 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.2 
 
 
351 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  33.58 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  33.58 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  33.58 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  33.58 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  33.66 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  33.92 
 
 
377 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  35.84 
 
 
358 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  33.92 
 
 
377 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  33.92 
 
 
377 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.47 
 
 
362 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  33.12 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  33.51 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.38 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  32.32 
 
 
413 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  30.83 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.89 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.89 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.89 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  33.96 
 
 
373 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  33.94 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  33.94 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  33.94 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  33 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  33.42 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  33.96 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  33.42 
 
 
354 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>