More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6816 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  36.57 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.14 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.94 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.33 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  34.31 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.74 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.7 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.63 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.85 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  25.54 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  25.88 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>