More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5507 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4159  porin  95.27 
 
 		 409 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  90.05 
 
 		 401 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  95.27 
 
 		 402 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  94.78 
 
 		 402 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  99.75 
 
 		 402 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  99.75 
 
 		 402 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  100 
 
 		 402 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  78.78 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  78.19 
 
 		 400 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  77.93 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  77.66 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  77.93 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  77.93 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  77.93 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  77.39 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  58.15 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  59.16 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  58.22 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.75 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.75 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.9 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.9 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.9 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.9 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.9 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.9 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.1 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.7 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.85 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.65 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.71 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.92 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.25 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  38.82 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  38.33 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.27 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.4 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  40 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  36.76 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  40 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  37.59 
 
 		 398 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  38.36 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  38.78 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.09 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  36.14 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  38.57 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  36.66 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  38.24 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  37.98 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  36.75 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  36.99 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  36.99 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  38.24 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.4 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.59 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  36.75 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  36.03 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  37.73 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  37.73 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  37.73 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  36.45 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  37.92 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  38.5 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  36.3 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.62 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  36.84 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.89 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.89 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.89 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.89 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.75 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  37.66 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  34.47 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  35.15 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  38.34 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  37.73 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.5 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  36.84 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  37.53 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  36.14 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  36.34 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  37.91 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  36.87 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  36.87 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  36.87 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  37.21 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  34.64 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  35.64 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.68 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  34.92 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  34.11 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  36.95 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>