More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5501 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
147 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  99.32 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  95.92 
 
 
147 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  95.92 
 
 
147 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  93.88 
 
 
147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  84.35 
 
 
374 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  85.03 
 
 
238 aa  261  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  84.35 
 
 
248 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  84.35 
 
 
177 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  84.35 
 
 
177 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  84.35 
 
 
177 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  84.35 
 
 
147 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  78.17 
 
 
152 aa  238  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  75.74 
 
 
144 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  73.53 
 
 
144 aa  225  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  55.8 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  50.7 
 
 
158 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  51.94 
 
 
141 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  48.39 
 
 
148 aa  126  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
137 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  51.56 
 
 
136 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
213 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
166 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  39.67 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  39.66 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  34.97 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  33.59 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  40.35 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  35.66 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  41.24 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  35.2 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  41.84 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  34.43 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  38.05 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  32.37 
 
 
185 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  35.09 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  33.08 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  31.34 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  46.97 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.89 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.43 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
127 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  37.82 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.84 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.09 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.09 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.79 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  32.26 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.59 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.45 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.34 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>