More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2984 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.32 
 
 
224 aa  322  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.13 
 
 
226 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
250 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
250 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
248 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
248 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
249 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0118382  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
248 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
250 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
249 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
249 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
265 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
253 aa  181  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1028  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  44.12 
 
 
250 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242243  normal  0.177071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.345481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  45.64 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
252 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
246 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
248 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
248 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
246 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
248 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0296  putative short-chain dehydrogenase/reductase  47.09 
 
 
250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
247 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
247 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00674966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
248 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
246 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
252 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.109042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  41.74 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  38.08 
 
 
240 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  41.32 
 
 
248 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  40.91 
 
 
248 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
233 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
233 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
268 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
233 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
234 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
240 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2285  acetoacetyl-CoA reductase  38.46 
 
 
255 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  35.27 
 
 
247 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.82 
 
 
240 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  38.68 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
247 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  34.44 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
247 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
249 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
282 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.33 
 
 
246 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
244 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
244 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
260 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
248 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  34.85 
 
 
246 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 
247 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.71 
 
 
247 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.87 
 
 
259 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.15 
 
 
246 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  33.61 
 
 
260 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
246 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.15 
 
 
246 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  35.27 
 
 
246 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  35.27 
 
 
246 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  37.34 
 
 
246 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.14 
 
 
247 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
248 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  37.5 
 
 
246 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  36.93 
 
 
246 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0435  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  33.61 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  33.61 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  33.61 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  36.86 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  33.61 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  34.02 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.15 
 
 
240 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  37.08 
 
 
246 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
248 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
257 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
244 aa  138  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>