More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0225 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  100 
 
 
695 aa  1392    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  43.84 
 
 
730 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.73 
 
 
758 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 
773 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 
772 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  27.64 
 
 
770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 
773 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  25.71 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  27.18 
 
 
1100 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 
1029 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
963 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4286  hypothetical protein  32.46 
 
 
687 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  36.62 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 
963 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  29.7 
 
 
674 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
1209 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  33.48 
 
 
395 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
435 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 
819 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 
726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0218  methyl accepting chemotaxis protein  41.25 
 
 
687 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.25 
 
 
687 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
381 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.3 
 
 
737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 
1207 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
913 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4466  methyl-accepting chemotaxis protein  33.59 
 
 
651 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
520 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1356 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
355 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.36 
 
 
1177 aa  124  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
651 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
651 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
651 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3758  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
651 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.32 
 
 
1212 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
651 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.61 
 
 
812 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 
651 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000238421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.95 
 
 
431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  30.41 
 
 
443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 
407 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  23.27 
 
 
1128 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
788 aa  112  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 
396 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
1397 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
426 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 
782 aa  109  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  27.16 
 
 
1111 aa  108  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
756 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
422 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.33 
 
 
1109 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 
795 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.551962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.27 
 
 
1075 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
531 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
439 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  28.5 
 
 
439 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  28.5 
 
 
439 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  24.18 
 
 
1127 aa  99  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
421 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 
682 aa  91.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 
417 aa  91.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
350 aa  89  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2079  putative sensor with HAMP domain protein  28.16 
 
 
509 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  26.77 
 
 
642 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.63 
 
 
1480 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
699 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0433  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 
776 aa  86.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.58 
 
 
708 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.02 
 
 
604 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0809  chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 
717 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  27.56 
 
 
1773 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 
800 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.4 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  22.26 
 
 
1374 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  28.47 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
873 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  21.55 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 
716 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  27.71 
 
 
1361 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
699 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.72 
 
 
716 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.816147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 
665 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.75 
 
 
695 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
679 aa  72  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  23.95 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  26.99 
 
 
816 aa  71.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  24.91 
 
 
1165 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
640 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  31.94 
 
 
1987 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  24.44 
 
 
1198 aa  70.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
705 aa  70.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.48 
 
 
705 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  24.56 
 
 
622 aa  70.5  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.1 
 
 
1468 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>