211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5678 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  80.53 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  80.53 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  80.12 
 
 		 512 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.85 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.54 
 
 		 439 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  48.31 
 
 		 548 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.27 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  47.03 
 
 		 546 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  49.44 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  46.87 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  47.68 
 
 		 423 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  46.13 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  48.1 
 
 		 454 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  33.7 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  33.58 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  31.58 
 
 		 436 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  31.41 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  31.64 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  30.38 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  29.07 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  30.97 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  31.05 
 
 		 412 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.12 
 
 		 831 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.11 
 
 		 2413 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.87 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.75 
 
 		 961 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1402 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.94 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.19 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1493 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.11 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.44 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  28.66 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.6 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.49 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.95 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  33.67 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 489 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1037 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.56 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  38.05 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  28.35 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.73 
 
 		 185 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 		 720 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  33.67 
 
 		 720 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  33.67 
 
 		 720 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1877 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  33.33 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1002 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.51 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  36.08 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 		 798 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1160 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 512 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  33.09 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 1261 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1281 aa  53.9  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.94 
 
 		 680 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 		 865 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  39.24 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1032 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  32.67 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.86 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.62 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.7 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.05 
 
 		 971 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  35.05 
 
 		 722 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  32.28 
 
 		 679 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  30.92 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.63 
 
 		 693 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  35.05 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  35.05 
 
 		 722 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  35.05 
 
 		 722 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  36.08 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  40.51 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  39.24 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  33.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.08 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 705 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 		 971 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  28.67 
 
 		 172 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>