197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00088 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  93.84 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  87.68 
 
 		 211 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  75.94 
 
 		 210 aa  335  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  52.88 
 
 		 214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  53.19 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  51.52 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  45.41 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  43.63 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  42.36 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.69 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  40.69 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  40.69 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  40.69 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  40.69 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  39.11 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  41.81 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  41.81 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.93 
 
 		 1263 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.02 
 
 		 1260 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.98 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  33.93 
 
 		 961 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.84 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.99 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.52 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 1072 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.97 
 
 		 684 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  52.4  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.26 
 
 		 838 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.32 
 
 		 343 aa  51.6  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.94 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 1012 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  39.24 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.99 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.1 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.62 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.69 
 
 		 831 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 722 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  40.85 
 
 		 679 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 722 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 722 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.72 
 
 		 376 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.72 
 
 		 376 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1002 aa  49.3  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.02 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.07 
 
 		 318 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.89 
 
 		 373 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1493 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.15 
 
 		 425 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  38.55 
 
 		 680 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 722 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  28.21 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.6 
 
 		 305 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 416 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.25 
 
 		 789 aa  48.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  30.49 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 997 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 693 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.93 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  29.52 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  30 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  32.06 
 
 		 403 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.99 
 
 		 961 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  25.86 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 1430 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  29.75 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  25 
 
 		 913 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 763 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  29.75 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  27.27 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  28.95 
 
 		 350 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 1261 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  26.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.07 
 
 		 490 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  32.33 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 346 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.22 
 
 		 489 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 		 523 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 448 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.85 
 
 		 865 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>