190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2771 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  100 
 
 
210 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  75.94 
 
 
211 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  74.53 
 
 
211 aa  330  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  75 
 
 
211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  54.68 
 
 
214 aa  215  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  55.06 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  48.53 
 
 
211 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  44.39 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 
213 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  40 
 
 
204 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  39.22 
 
 
207 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  41.33 
 
 
218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  41.33 
 
 
218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  41.33 
 
 
218 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  41.11 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  39.3 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  39.8 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  41.57 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.8 
 
 
218 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  39.8 
 
 
218 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  39.8 
 
 
218 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  39.33 
 
 
205 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.47 
 
 
1263 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  34.55 
 
 
961 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.91 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.96 
 
 
1260 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  41.77 
 
 
372 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.66 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.32 
 
 
1072 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 
416 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.26 
 
 
838 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.45 
 
 
255 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.29 
 
 
684 aa  51.6  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 
347 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  39.44 
 
 
679 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.52 
 
 
831 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.3 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12410  tetratricopeptide-like helical protein  31 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.39 
 
 
343 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.51 
 
 
325 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.32 
 
 
680 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.17 
 
 
1037 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.35 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.61 
 
 
1002 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.93 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.28 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  28.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  37.66 
 
 
512 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  33.72 
 
 
540 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.32 
 
 
373 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.46 
 
 
360 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  32.29 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  27.59 
 
 
233 aa  48.9  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.04 
 
 
1012 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
393 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.29 
 
 
425 aa  48.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  25.7 
 
 
246 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.21 
 
 
789 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.56 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.89 
 
 
360 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34 
 
 
489 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1202  hypothetical protein  37.66 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.1 
 
 
850 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  27.84 
 
 
381 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  32.8 
 
 
438 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.91 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.25 
 
 
693 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.42 
 
 
1493 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  32.63 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 
257 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  30.91 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 
248 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  30.63 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.17 
 
 
315 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 
403 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  32.63 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  32.63 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  30.91 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  32.63 
 
 
258 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.21 
 
 
961 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
448 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25 
 
 
1200 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 
328 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  36.36 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
303 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>