133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3867 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 		 305 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  98.03 
 
 		 305 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  89.84 
 
 		 305 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  90.49 
 
 		 305 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  90.49 
 
 		 305 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  89.84 
 
 		 305 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  56.41 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  56.41 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  44.14 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  41.44 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  39.36 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  36.36 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  38.64 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  37.12 
 
 		 473 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  38.64 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  39.29 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  39.29 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  39.47 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  37.99 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  37.99 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  37.99 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  37.99 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  39.14 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  39.14 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  39.67 
 
 		 346 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  39.8 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  39.79 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  39.79 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  39.26 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  39.51 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  38.03 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  38.16 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  40.07 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  37.33 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  38.43 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  38.54 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.64 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  34.85 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  31.5 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  35.38 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  29.72 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  37.37 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  34.84 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  37.37 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  37.37 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  37.37 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  37.37 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  37.37 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  37.54 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  35.53 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  30.74 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  34.87 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  35.99 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.61 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  33.33 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  35.49 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.5 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.7 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  32.74 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  33.99 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  25.63 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  34.39 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.06 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  33.07 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.11 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  30.22 
 
 		 405 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.58 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  25.23 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  23.48 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  37.8 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  28.15 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  38.2 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  29.59 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.91 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  31.68 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  40.3 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  28.28 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>