More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1588 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  93.21 
 
 		 442 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  98.87 
 
 		 442 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  64.09 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  63.57 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  63.81 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  59.02 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  56.94 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  60.1 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  39 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 447 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 444 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 416 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 		 426 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 438 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.68 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 470 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.61 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 435 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 506 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 430 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.23 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  25.61 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>