173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1250 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  96.9 
 
 		 290 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  82.76 
 
 		 290 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  60.48 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  60.48 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  60.48 
 
 		 291 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  55.07 
 
 		 270 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  50.36 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  50 
 
 		 276 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  51.42 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  51.42 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  51.06 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  53.02 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  51.06 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  51.06 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  51.06 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  49.64 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  51.26 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  46.04 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  47 
 
 		 290 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  47.48 
 
 		 272 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  41.3 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  43.63 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  40.28 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  44.52 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  43.16 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  38.04 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  42.36 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.93 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  39.86 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.4 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  38.85 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  36.4 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  38.16 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  34.59 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  34.59 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  33.79 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  38.08 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.24 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.25 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  34.68 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.18 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.44 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  28 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.69 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.1 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.83 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.92 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  32.47 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.04 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  37.61 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>