More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0712 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0712  SIS domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3836  RpiR family transcriptional regulator  89.41 
 
 		 277 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0075  transcriptional regulator RpiR family  74.02 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  39.2 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  39.76 
 
 		 285 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  38.98 
 
 		 285 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 280 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  39.04 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  36.22 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  35.86 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  36.25 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  35.86 
 
 		 375 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  38.96 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  37.5 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  38 
 
 		 310 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  38.1 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  38.4 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1136  transcriptional regulator, RpiR family  33.98 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0983  transcriptional regulator, RpiR family  33.85 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3546  RpiR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  37.55 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3702  RpiR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2326  RpiR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  29.75 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  27.63 
 
 		 297 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 310 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  29.87 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  29.95 
 
 		 331 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4614  transcriptional regulator, RpiR family  32.05 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1152  RpiR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 326 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2002  RpiR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  27.52 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1253  RpiR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0224504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1140  RpiR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  24.23 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5469  transcriptional regulator, RpiR family  30.25 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  28.22 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0051  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.27 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000270259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0831  hypothetical protein  28.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111957  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0867  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2209  putative DNA-binding protein  28.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00094108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0959  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00212362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1569  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.27 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00731797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5218  RpiR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.398124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  30.56 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  25.41 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0175  RpiR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  23.01 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  27.06 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>