More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0400 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
387 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  69.47 
 
 
403 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  70.08 
 
 
401 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  55.87 
 
 
408 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  31.82 
 
 
414 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
416 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 
416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2866  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.76 
 
 
413 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.814502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
414 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  32 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 
402 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
402 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
394 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
416 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
383 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.59 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.65 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 
421 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.18 
 
 
381 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
381 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  30.16 
 
 
368 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
406 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
378 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
378 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
368 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  30.16 
 
 
368 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
372 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
372 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
368 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
401 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  27.12 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.37 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
439 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  32.51 
 
 
368 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
373 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.37 
 
 
401 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
372 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
370 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
364 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
339 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
368 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
366 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
373 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
377 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 
375 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
374 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
373 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
417 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
374 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
378 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.24 
 
 
371 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
402 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.24 
 
 
371 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
384 aa  103  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
374 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
374 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 
367 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  31.33 
 
 
370 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
370 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
373 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.19 
 
 
380 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
366 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.44 
 
 
371 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
373 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
419 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  30.4 
 
 
367 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
415 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  30.77 
 
 
413 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  30.77 
 
 
374 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3836  leucine-specific-binding protein  29.96 
 
 
365 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  29.96 
 
 
367 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3879  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  29.96 
 
 
367 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
375 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
364 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3769  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  29.96 
 
 
365 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 
367 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
406 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>