202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1290 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  96.53 
 
 
370 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  96.53 
 
 
317 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  96.21 
 
 
317 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  85.45 
 
 
323 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  61.94 
 
 
305 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  59.94 
 
 
311 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  60.26 
 
 
466 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  60.66 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  62.5 
 
 
325 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  62.5 
 
 
325 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  62.5 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  59 
 
 
311 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  57.89 
 
 
311 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  57.57 
 
 
311 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  53.02 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 
313 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.2 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  41.76 
 
 
333 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  41.69 
 
 
305 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  40.29 
 
 
333 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  40.83 
 
 
334 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.78 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  37.38 
 
 
322 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  38.63 
 
 
330 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 
315 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
314 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.1 
 
 
326 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  33.56 
 
 
341 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 
302 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.23 
 
 
346 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.06 
 
 
326 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 
333 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.41 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.23 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.07 
 
 
304 aa  92.8  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.72 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.46 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.99 
 
 
328 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.88 
 
 
328 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.12 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 
324 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.33 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  32.12 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  24.59 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.02 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  34.23 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.74 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  29.6 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  35.09 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.88 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.13 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.81 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.04 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  23.69 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.86 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.76 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.74 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.14 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.71 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  24.37 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.47 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.08 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.04 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>