More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0624 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0624  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis ATPase  100 
 
 
322 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00264266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0368  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.79 
 
 
260 aa  235  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
223 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  37.5 
 
 
221 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  37.9 
 
 
226 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  36.26 
 
 
250 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.96 
 
 
648 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.96 
 
 
648 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  35.82 
 
 
388 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  32.97 
 
 
234 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
238 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
388 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  32.49 
 
 
234 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  33.33 
 
 
222 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.75 
 
 
653 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  33.58 
 
 
230 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
222 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  36.4 
 
 
648 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  34.04 
 
 
228 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  33.45 
 
 
234 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  34.32 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  34.44 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 
224 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  34.81 
 
 
649 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  33.7 
 
 
235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  35.11 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0080  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  35.11 
 
 
253 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.33 
 
 
642 aa  145  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  32.84 
 
 
226 aa  145  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  31.37 
 
 
235 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  31.25 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
234 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.77 
 
 
230 aa  145  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 
233 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  32.35 
 
 
260 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  33.56 
 
 
658 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 
225 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  33.21 
 
 
231 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  36.57 
 
 
248 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  33.21 
 
 
231 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  38.58 
 
 
283 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  35.46 
 
 
252 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  39.57 
 
 
248 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  34.07 
 
 
678 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.07 
 
 
678 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  34.07 
 
 
678 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 
648 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.97 
 
 
244 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 
648 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  35.06 
 
 
227 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 
246 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 
648 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 
648 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 
648 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.43 
 
 
232 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  30.88 
 
 
228 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
228 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.32 
 
 
663 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  35.86 
 
 
251 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 
240 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
228 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.07 
 
 
232 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
274 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.81 
 
 
649 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  33.09 
 
 
682 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3894  ABC transporter related  34.8 
 
 
222 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  35.58 
 
 
225 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.07 
 
 
232 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.58 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.19 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36 
 
 
232 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.69 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  33.09 
 
 
682 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  32.48 
 
 
225 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  31.25 
 
 
221 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  32.59 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.93 
 
 
663 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  31.73 
 
 
253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  33.09 
 
 
667 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  33.46 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  31.99 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  33.09 
 
 
667 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  31.73 
 
 
253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  33.57 
 
 
661 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  31.75 
 
 
234 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  33.45 
 
 
247 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  34.26 
 
 
228 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  33.33 
 
 
715 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  34.74 
 
 
252 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  32.61 
 
 
227 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  30.43 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2513  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>