More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0368 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0368  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0624  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis ATPase  45.42 
 
 		 322 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00264266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  41.13 
 
 		 221 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  38.68 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  34.17 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  36.29 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2229  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00449183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2513  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2503  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2307  ABC transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00152592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2275  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2482  ABC transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  36.52 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2578  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  37.86 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  36.52 
 
 		 232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 		 224 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  35.27 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  35.44 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  36.63 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  35.15 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.33 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37.66 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  36.09 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 		 228 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  36.24 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  34.6 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  34.71 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  34.58 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  33.47 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  34.87 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  34.73 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  35.29 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  34.6 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  34.57 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  34.73 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  37.61 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.65 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  36.36 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  32.5 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.08 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  32.77 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  38.53 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.53 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  38.01 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  31.82 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  38.53 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  34.18 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  33.33 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  34.87 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.05 
 
 		 664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  34.02 
 
 		 664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  32.5 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  35.53 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  35 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  32.5 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 219 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  33.48 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  37.28 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  31.67 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.53 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  35.8 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  40.09 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>