More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3894 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3894  ABC transporter related  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  47.96 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.74 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.72 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.69 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.36 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.2 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  44.14 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  44.14 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 232 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  44.29 
 
 		 715 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.19 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.58 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  45.29 
 
 		 707 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  44.95 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.13 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.44 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.21 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  41.28 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  44.55 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  43.69 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  44.55 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  45.78 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  42.79 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  39.19 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.99 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  43.44 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  40.83 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.69 
 
 		 646 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  41.44 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.1 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.03 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  41.1 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  41.74 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  41.82 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  42.66 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  43.18 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  37.56 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.78 
 
 		 642 aa  175  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  44.19 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  42.08 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 		 286 aa  175  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.47 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  44.34 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.08 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.34 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.14 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  41.44 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  38.99 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  39.64 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.08 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  40.72 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.99 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  40.27 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  41.89 
 
 		 652 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  40.99 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  41.44 
 
 		 226 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.37 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 265 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.62 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.2 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  38.91 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.2 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>