More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5380 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  94.25 
 
 		 522 aa  980    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  93.87 
 
 		 522 aa  979    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  94.06 
 
 		 522 aa  982    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  94.64 
 
 		 522 aa  983    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  93.49 
 
 		 522 aa  974    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  100 
 
 		 522 aa  1034    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  94.06 
 
 		 522 aa  982    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  94.25 
 
 		 522 aa  984    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  94.06 
 
 		 522 aa  982    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  98.85 
 
 		 522 aa  1024    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  58.67 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  53.39 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  55.86 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  53.23 
 
 		 549 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  54.08 
 
 		 539 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  52.62 
 
 		 533 aa  551  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  53.11 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  51.81 
 
 		 554 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  52.52 
 
 		 534 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  52.22 
 
 		 524 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  49.6 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  51.9 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  47.15 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  48.61 
 
 		 516 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  48.21 
 
 		 516 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  49.5 
 
 		 518 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  46.17 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  45.27 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  39.28 
 
 		 519 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  41.32 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.72 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  34.01 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  50.18 
 
 		 341 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  36.29 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 659 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 659 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  33.01 
 
 		 538 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.21 
 
 		 498 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.57 
 
 		 550 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.97 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  32.02 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 520 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 520 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  33.92 
 
 		 523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  29.75 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  33.26 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  33.05 
 
 		 516 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  33.05 
 
 		 516 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  33.05 
 
 		 516 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  32.32 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  33.26 
 
 		 516 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  34.26 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.82 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  32.83 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  32.83 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.31 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.17 
 
 		 530 aa  240  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  31.84 
 
 		 584 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  30.9 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.8 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.98 
 
 		 573 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  32.52 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.84 
 
 		 516 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.26 
 
 		 606 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  31.8 
 
 		 661 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  29.82 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  33.26 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.56 
 
 		 637 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  32.98 
 
 		 681 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  30.77 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  31.71 
 
 		 526 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.15 
 
 		 600 aa  233  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  30.93 
 
 		 523 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  32.24 
 
 		 539 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  31.98 
 
 		 644 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  30.9 
 
 		 550 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  30.82 
 
 		 678 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.75 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.6 
 
 		 661 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  29.14 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  30.65 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.75 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  33.13 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  29.61 
 
 		 580 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 504 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  32.1 
 
 		 525 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  32.06 
 
 		 646 aa  226  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.17 
 
 		 529 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>