More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3308 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  99.28 
 
 
144 aa  286  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  99.28 
 
 
144 aa  286  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  99.28 
 
 
144 aa  286  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  286  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  99.28 
 
 
138 aa  285  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  99.28 
 
 
138 aa  285  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  99.28 
 
 
138 aa  285  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  99.28 
 
 
138 aa  285  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  98.55 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  94.93 
 
 
139 aa  276  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  81.16 
 
 
139 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
141 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
141 aa  146  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30.5 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  26.62 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  25.78 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  20.74 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  25.6 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  27.97 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>