69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0070 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  52.46 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  39 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  43.02 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  44.59 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  36.5 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  39.43 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  35.5 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  35.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  37.7 
 
 		 260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 293 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  37.27 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  37.27 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  37.27 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  33.14 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  31.68 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  32.66 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  35.85 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  35.19 
 
 		 260 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  35.6 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  33.14 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  35.52 
 
 		 373 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 379 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  33.68 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  33.55 
 
 		 414 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  34.25 
 
 		 414 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  37.01 
 
 		 382 aa  88.2  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  37.23 
 
 		 878 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  30.99 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  29.61 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  35.44 
 
 		 644 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  33.33 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 640 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  33.33 
 
 		 642 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  34.18 
 
 		 649 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.22 
 
 		 640 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.73 
 
 		 632 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 647 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  32.58 
 
 		 642 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  32.58 
 
 		 642 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.75 
 
 		 632 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  32.58 
 
 		 629 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 631 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  30.19 
 
 		 636 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  35.44 
 
 		 556 aa  48.5  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.26 
 
 		 643 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  29.25 
 
 		 647 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  27.01 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 101 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  35.63 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  26.92 
 
 		 633 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  28.12 
 
 		 652 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 702 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 702 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.21 
 
 		 388 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  32.1 
 
 		 138 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  25.9 
 
 		 683 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.21 
 
 		 388 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.53 
 
 		 653 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.71 
 
 		 657 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 320 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>