More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7636 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 162 aa  213  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  65.22 
 
 		 161 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.85 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.35 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  33.61 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.37 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  34.68 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  37.93 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.81 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.32 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31.03 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>