91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4962 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 1136 aa  2324    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  27.08 
 
 		 787 aa  134  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 		 1760 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1026 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1510 aa  91.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.85 
 
 		 1599 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 		 1046 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.48 
 
 		 1684 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.95 
 
 		 1617 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.04 
 
 		 1583 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 1078 aa  80.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.49 
 
 		 1190 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 		 1308 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.17 
 
 		 1598 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 		 1344 aa  78.2  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.92 
 
 		 1609 aa  74.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.21 
 
 		 1334 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  23.78 
 
 		 902 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1152 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 1240 aa  73.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 1020 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.02 
 
 		 1686 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 		 1236 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 1032 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 1014 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 1005 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1157 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 969 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 969 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.67 
 
 		 1711 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 965 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1073 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  36.89 
 
 		 1401 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.16 
 
 		 1398 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 1353 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1424 aa  64.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.55 
 
 		 1547 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.62 
 
 		 1607 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.05 
 
 		 1481 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.62 
 
 		 1623 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 		 994 aa  62  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  36.84 
 
 		 1553 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  40.45 
 
 		 1074 aa  60.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1432 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 		 1491 aa  60.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45 
 
 		 1626 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  47.62 
 
 		 1124 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  49.18 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 1092 aa  59.3  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 		 1314 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  47.46 
 
 		 1194 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1265 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1043 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  48.44 
 
 		 1733 aa  58.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  47.83 
 
 		 1699 aa  58.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  43.08 
 
 		 1102 aa  58.2  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  40.23 
 
 		 1131 aa  58.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1657 aa  58.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1075 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 947 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1089 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1067 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.05 
 
 		 1823 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1392 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 		 973 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  44.62 
 
 		 1357 aa  56.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1089 aa  56.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 1075 aa  55.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 		 1229 aa  55.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1075 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1092 aa  55.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 1080 aa  55.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 1063 aa  55.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 		 1152 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 712 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  47.06 
 
 		 1355 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 885 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  50 
 
 		 1264 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  50 
 
 		 1264 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 1187 aa  52  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 901 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  41.27 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  22.74 
 
 		 1085 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1399 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.67 
 
 		 1267 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  40.68 
 
 		 1230 aa  45.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>