More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2210 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  53.01 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 208 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 202 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  38.65 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 219 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  29.76 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32500  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275577  normal  0.254114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  35.12 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  26.29 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.89 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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