More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
710 aa  1455    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
708 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 
811 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 
811 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
728 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 
774 aa  256  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 
718 aa  254  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 
728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
698 aa  241  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 
742 aa  240  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 
727 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  30.79 
 
 
771 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 
710 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 
729 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
808 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 
708 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  30.69 
 
 
744 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 
755 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
726 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
710 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 
777 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
727 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 
754 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 
753 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.85 
 
 
705 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  29.08 
 
 
746 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
685 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
762 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 
722 aa  207  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 
730 aa  207  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
725 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 
802 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
729 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
757 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
823 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 
805 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
742 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
750 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 
749 aa  200  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 
819 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 
702 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 
712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 
706 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
738 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.4 
 
 
730 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 
702 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 
734 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 
801 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
768 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
772 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
772 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.55 
 
 
724 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 
719 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.99 
 
 
804 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
879 aa  193  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 
726 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 
758 aa  193  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 
839 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 
801 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
753 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 
751 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 
851 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
728 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.99 
 
 
804 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
715 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 
724 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
743 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
707 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
743 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
743 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 
800 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 
722 aa  187  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  27.92 
 
 
700 aa  187  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
743 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 
728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 
707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 
707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
773 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 
743 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
770 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 
737 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 
729 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 
743 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 
729 aa  177  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
772 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 
756 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.86 
 
 
737 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 
761 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
809 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
821 aa  173  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
712 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
730 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.65 
 
 
704 aa  170  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  28 
 
 
729 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 
773 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 
746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>