More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4035 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  100 
 
 
273 aa  563  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  60.66 
 
 
273 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  55.51 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  53.07 
 
 
276 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  50.57 
 
 
273 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  49.63 
 
 
273 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  47.55 
 
 
284 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  50 
 
 
253 aa  228  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  46.13 
 
 
274 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  44.57 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  47.6 
 
 
273 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  45.86 
 
 
286 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  41.37 
 
 
285 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  45.83 
 
 
304 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  44.12 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  39.52 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  38.57 
 
 
261 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  40.27 
 
 
244 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  40.72 
 
 
244 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  37.1 
 
 
244 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.69 
 
 
244 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.69 
 
 
244 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.69 
 
 
244 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  38.37 
 
 
251 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.69 
 
 
244 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.29 
 
 
244 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  36.69 
 
 
244 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.29 
 
 
244 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  36.1 
 
 
253 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.57 
 
 
248 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.24 
 
 
240 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  37.73 
 
 
240 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  38.94 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  35.37 
 
 
257 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  39.04 
 
 
240 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  35.86 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  35.86 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  35.86 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  35.46 
 
 
240 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  35.44 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  35.44 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  36.32 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  35.44 
 
 
240 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  35.86 
 
 
240 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  35.44 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  35.44 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  37.67 
 
 
316 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  34.26 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.66 
 
 
250 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  32.8 
 
 
246 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  33.33 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  33.33 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  36.82 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  36.82 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  36.82 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  36.82 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.62 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.44 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  36.36 
 
 
240 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  35.75 
 
 
239 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  36.13 
 
 
239 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31.38 
 
 
240 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  34.38 
 
 
242 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  30.89 
 
 
269 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.14 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.6 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  31.7 
 
 
246 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  36.55 
 
 
240 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  36.71 
 
 
240 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  32.42 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  36.93 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  33.79 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  30.99 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.67 
 
 
248 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  28.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  25.3 
 
 
251 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  28.89 
 
 
265 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  31.41 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.69 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  37.96 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.53 
 
 
174 aa  82  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  38.06 
 
 
238 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.57 
 
 
170 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  24.44 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.35 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.96 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.81 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.73 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  30 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.22 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.15 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
188 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.6 
 
 
165 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.92 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.63 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.98 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.09 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.88 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.06 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>