88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1130 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  100 
 
 		 481 aa  955    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  44.94 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  47.64 
 
 		 666 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  29.19 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  26.74 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  35.11 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  33.92 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  29.96 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.4 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  20.06 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  21.97 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  21.97 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  21.97 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.41 
 
 		 460 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  22.65 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.28 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.54 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.28 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.82 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.34 
 
 		 390 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  22.16 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.58 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 314 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.58 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  22.81 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  19.71 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.76 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.74 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.87 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.99 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  29 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.67 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.72 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.65 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.47 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  32.1 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.1 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.28 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.71 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  41.18 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.68 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  25 
 
 		 515 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.68 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  24.36 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.47 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.27 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  30 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.16 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.47 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.51 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  32.32 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 369 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.16 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 397 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  21.64 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.24 
 
 		 511 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.47 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 		 390 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  35.53 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2947  hypothetical protein  39.62 
 
 		 169 aa  43.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.09 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  25.97 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 479 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>