More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0528 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 
355 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  75.56 
 
 
360 aa  571  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  48.19 
 
 
339 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  50.57 
 
 
324 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  50.85 
 
 
328 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  49.03 
 
 
320 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  49.03 
 
 
320 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  45.18 
 
 
321 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  46.57 
 
 
336 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  43.89 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  48.27 
 
 
351 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  38.89 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  40.39 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.62 
 
 
291 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.62 
 
 
270 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.77 
 
 
270 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.98 
 
 
267 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.65 
 
 
267 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.2 
 
 
267 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.28 
 
 
267 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  31.68 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 
298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  32.66 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.89 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 
302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  54.13 
 
 
275 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  29.05 
 
 
299 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  29.12 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  46.46 
 
 
337 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  47.37 
 
 
316 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  48.25 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  48.25 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  44.83 
 
 
344 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  29.54 
 
 
256 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.31 
 
 
311 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  41.04 
 
 
243 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  38.74 
 
 
211 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  42.45 
 
 
318 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 
330 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  43.64 
 
 
389 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.52 
 
 
408 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  35.62 
 
 
384 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 
342 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  36.3 
 
 
399 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  42.02 
 
 
350 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  42.02 
 
 
350 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  42.02 
 
 
350 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  43.52 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  49.43 
 
 
271 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  37.98 
 
 
269 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  34.16 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  34.16 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  39.84 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  41.53 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  25.61 
 
 
273 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  26.37 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  35.82 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  33.12 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  40.34 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
314 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  40.32 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  39.83 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  39.83 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  26.76 
 
 
299 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  40.31 
 
 
345 aa  95.9  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  40.87 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  39.29 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  46.67 
 
 
280 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  45.1 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  41.07 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  41.59 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  40.34 
 
 
313 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.83 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 
301 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  46.67 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  46.6 
 
 
272 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  25.08 
 
 
370 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  39.45 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  40.37 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  35.56 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 
382 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.7 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
260 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  43.27 
 
 
405 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  44.44 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  27.18 
 
 
402 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  37.17 
 
 
235 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 
287 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  33.54 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  32.1 
 
 
444 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  42.61 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  35.82 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  37.17 
 
 
272 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>