More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4237 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  89.81 
 
 
108 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 
117 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 
117 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 
117 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  69 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  70 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  73.47 
 
 
107 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  74.73 
 
 
111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  64.42 
 
 
151 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  67 
 
 
118 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  63 
 
 
109 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  63 
 
 
109 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  70 
 
 
168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.15 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  62.62 
 
 
134 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  61.36 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 
119 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  59.77 
 
 
118 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  53.47 
 
 
119 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 
119 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
119 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
119 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
115 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  55.42 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  47.76 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
122 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
245 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
399 aa  53.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
115 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  45 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  40.32 
 
 
127 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  42.62 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
241 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
241 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  40.32 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  40.32 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5197  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
229 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.539202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
227 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 
229 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
232 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
232 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
228 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
228 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>