More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2217 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  90 
 
 		 290 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  54.78 
 
 		 286 aa  318  9e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  51.36 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  52.26 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  51.94 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  51.74 
 
 		 288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  52.36 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  52.38 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  51.36 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  46.83 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  42.27 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  41.35 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  40.81 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  42.8 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  40.88 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  42.68 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  42.79 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  42.44 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.42 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  39.83 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  36.5 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  34.63 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  35.27 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  34.39 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  32.21 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  32.76 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 344 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  35.22 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  38.22 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35.91 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 		 367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  37.17 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  31.69 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 524 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 		 518 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.17 
 
 		 511 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 528 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 518 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 518 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.58 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 		 399 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 521 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 518 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  33 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 		 513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  30.13 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  30.18 
 
 		 513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  32.71 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 513 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  42.42 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.82 
 
 		 513 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 351 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 		 520 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  30.28 
 
 		 321 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 512 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 523 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.06 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  29.01 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  30.63 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.23 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  43.55 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.54 
 
 		 375 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  31.45 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  31.45 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.24 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.29 
 
 		 525 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.28 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.88 
 
 		 408 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 405 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.69 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>