256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1366 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  100 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  64.34 
 
 		 193 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  48.2 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  50.39 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  46 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  43.98 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.84 
 
 		 238 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  43.98 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  43.98 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  41.77 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  44.83 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  46.76 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  46.04 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  49.18 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  42.11 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  43.8 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  45.24 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  39.62 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  43.06 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.9 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  45.27 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  46.9 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  46.32 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  43.26 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  43.38 
 
 		 139 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  44.54 
 
 		 291 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  43.8 
 
 		 269 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  42.97 
 
 		 362 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  45.95 
 
 		 331 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  38.71 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  41.27 
 
 		 254 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  43.44 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.78 
 
 		 271 aa  74.7  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  31.71 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  31.71 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  31.71 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  31.71 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  31.71 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  31.71 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  30.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  30.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  30.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  30.89 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  33.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  31.93 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  34.34 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.41 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  32.32 
 
 		 299 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.32 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  31.68 
 
 		 308 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  32.08 
 
 		 285 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  26.14 
 
 		 274 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  29.27 
 
 		 299 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  33.33 
 
 		 299 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  32.73 
 
 		 285 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  27.34 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.48 
 
 		 273 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  32.69 
 
 		 302 aa  51.2  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  36 
 
 		 253 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  30.09 
 
 		 286 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  34.65 
 
 		 423 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.48 
 
 		 244 aa  50.8  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.43 
 
 		 285 aa  50.8  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  26.14 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.35 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.73 
 
 		 395 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  35.71 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  30.71 
 
 		 446 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  32.32 
 
 		 299 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  29.13 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  24.84 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  34.91 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.19 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  26.19 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  32 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  26.19 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.71 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  35.24 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  26.19 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  31.13 
 
 		 247 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  34.65 
 
 		 312 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.95 
 
 		 425 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  33.33 
 
 		 490 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 		 269 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  33.33 
 
 		 468 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  29.13 
 
 		 471 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.33 
 
 		 404 aa  48.5  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  32.32 
 
 		 279 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  33.1 
 
 		 610 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  34.78 
 
 		 294 aa  48.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.33 
 
 		 437 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  29.91 
 
 		 280 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 296 aa  48.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  34.04 
 
 		 367 aa  47.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  30.28 
 
 		 300 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  33.33 
 
 		 440 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  33.63 
 
 		 457 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  33.33 
 
 		 440 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>