More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1011 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  100 
 
 		 473 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  32.57 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04410  arabinose efflux permease family protein  32.27 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.684912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1748  major facilitator superfamily permease  33.41 
 
 		 476 aa  193  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000637074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 482 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 491 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 491 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  27.54 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5926  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.29 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  29.71 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  27.2 
 
 		 485 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 494 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 507 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.76 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 491 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 484 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 650 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.44 
 
 		 478 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 525 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  25.92 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  28.44 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  29.81 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 643 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 643 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  26.64 
 
 		 643 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  26.2 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  27.89 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.35 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.41 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 1102 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.49 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 		 697 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.49 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  25.47 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>