More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1504 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1504  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 438 aa  844    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1599  (Uracil-5)-methyltransferase  98.4 
 
 		 438 aa  830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2360  (Uracil-5)-methyltransferase  94.29 
 
 		 438 aa  804    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1509  (Uracil-5)-methyltransferase  70.51 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.96 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  36.28 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  34.36 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  32.15 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.33 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.65 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  35.25 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.83 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  29.89 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0965  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.99 
 
 		 473 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.82 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  35.71 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.54 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  30.07 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1053  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.41 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0704597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.76 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.611309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52190  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.91 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.97 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.41 
 
 		 487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.7 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1693  RNA methyltransferase, TrmA family  35.36 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  27 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1898  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.23 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.75216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  35.22 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.58 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.32 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  31.78 
 
 		 457 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  29.68 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3696  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.04 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116143  hitchhiker  0.00123497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.76 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.76 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.6 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  31.22 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.6 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3690  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.68 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391491  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.4 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.57 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0203471  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  26.01 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4577  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.85 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.63 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  29.81 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.51 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.48 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1840  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2195  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  34.74 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.21 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  25.54 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.48 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  35.98 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4218  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.73 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.076322  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1919  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.48 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  29.77 
 
 		 455 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0970  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.29 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.98 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.58 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.43 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  31.69 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2092  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.38 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.54 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1256  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.27 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2229  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.69 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  26.98 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.09 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.89 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  31.45 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.73 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.05 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.74 
 
 		 447 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  26.71 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  29.57 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.02 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  25.05 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.41 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  35.1 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  26.3 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  29.74 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.45 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1256  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.47 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  26.87 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  28.82 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  30.62 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 465 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  28.45 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3237  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.49 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0193521  normal  0.0341148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>