More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1509 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1509  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
482 aa  925    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1599  (Uracil-5)-methyltransferase  70.73 
 
 
438 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2360  (Uracil-5)-methyltransferase  70.73 
 
 
438 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1504  (Uracil-5)-methyltransferase  70.51 
 
 
438 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  30.86 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  30.86 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.99 
 
 
455 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  28.75 
 
 
439 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  31.24 
 
 
457 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.28 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  29.19 
 
 
439 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  32.57 
 
 
438 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  29.94 
 
 
460 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.4 
 
 
460 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.77 
 
 
455 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  29.1 
 
 
457 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  30.41 
 
 
446 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.76 
 
 
458 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.54 
 
 
440 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.49 
 
 
440 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  24.47 
 
 
419 aa  156  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52190  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.83 
 
 
450 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.19 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  27.42 
 
 
460 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  27.73 
 
 
458 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  27.73 
 
 
458 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  27.73 
 
 
458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  25.56 
 
 
448 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.42 
 
 
458 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.71 
 
 
436 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.35 
 
 
439 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4577  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.93 
 
 
452 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
434 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 
437 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  27.53 
 
 
458 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  27.53 
 
 
458 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  27.13 
 
 
454 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.67 
 
 
485 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3690  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30.28 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391491  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  27.22 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  26.4 
 
 
460 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  27.22 
 
 
458 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  27.45 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  26.5 
 
 
453 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  25.62 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 
458 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  28.54 
 
 
424 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.93 
 
 
455 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0965  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.56 
 
 
473 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.5 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1053  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.13 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0704597  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  27.99 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.9 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  26.29 
 
 
468 aa  141  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  24.85 
 
 
479 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  32.45 
 
 
446 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  28.39 
 
 
397 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.39 
 
 
496 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.611309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.78 
 
 
445 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  27.57 
 
 
459 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1693  RNA methyltransferase, TrmA family  35.83 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.4 
 
 
449 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4218  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.92 
 
 
461 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.076322  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.98 
 
 
472 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  26.99 
 
 
457 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3696  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.41 
 
 
451 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116143  hitchhiker  0.00123497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.04 
 
 
444 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.54 
 
 
449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.74 
 
 
489 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  31.35 
 
 
438 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  28 
 
 
446 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.46 
 
 
434 aa  136  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.8 
 
 
472 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.67 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0094  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.18 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.146255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  22.58 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  31.45 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1898  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.55 
 
 
443 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.75216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2092  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.43 
 
 
463 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.66 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374519  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2229  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.14 
 
 
498 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2195  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
485 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  27.95 
 
 
465 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1840  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.32 
 
 
485 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.56 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0344  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.13 
 
 
512 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.42 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  24.35 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  32.56 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4063  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.6 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395804  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  26.67 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37070  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.84 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.584008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>