More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1599 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1599  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
438 aa  844    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1504  (Uracil-5)-methyltransferase  98.4 
 
 
438 aa  830    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2360  (Uracil-5)-methyltransferase  94.75 
 
 
438 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1509  (Uracil-5)-methyltransferase  70.73 
 
 
482 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  36.59 
 
 
438 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.78 
 
 
440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.74 
 
 
419 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  33.55 
 
 
446 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  32.15 
 
 
439 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  33.63 
 
 
434 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  35.48 
 
 
437 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.33 
 
 
455 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0965  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.2 
 
 
473 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.95 
 
 
439 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  29.82 
 
 
439 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.82 
 
 
436 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  35.49 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  31.26 
 
 
424 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  32.2 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4577  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.54 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.4 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.73 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.19 
 
 
487 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4218  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.24 
 
 
461 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.076322  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1053  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 
450 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0704597  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.89 
 
 
496 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.611309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52190  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.83 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  35.22 
 
 
455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3690  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.68 
 
 
491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391491  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  29.17 
 
 
453 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1693  RNA methyltransferase, TrmA family  35.14 
 
 
451 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1898  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.57 
 
 
443 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.75216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.11 
 
 
450 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  30.02 
 
 
440 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.19 
 
 
485 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  26.78 
 
 
448 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.55 
 
 
465 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.55 
 
 
465 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.33 
 
 
465 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3696  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.81 
 
 
451 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116143  hitchhiker  0.00123497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.25 
 
 
460 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.25 
 
 
460 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
465 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  35.82 
 
 
414 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.26 
 
 
444 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.2 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  34.52 
 
 
438 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1919  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.7 
 
 
498 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.44 
 
 
452 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.26 
 
 
484 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.13 
 
 
468 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  29.22 
 
 
405 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  29.68 
 
 
455 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.26 
 
 
484 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.06 
 
 
460 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.69 
 
 
449 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.32 
 
 
461 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.32 
 
 
461 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.12 
 
 
465 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.71 
 
 
491 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0203471  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1840  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
485 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
465 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
465 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
465 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.88 
 
 
472 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
465 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.63 
 
 
441 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2195  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.19 
 
 
485 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.63 
 
 
434 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  26.52 
 
 
454 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  26.18 
 
 
446 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2092  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.99 
 
 
463 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0970  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.35 
 
 
432 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  32.58 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  30.35 
 
 
457 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  31.42 
 
 
457 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2229  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.55 
 
 
498 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  26.17 
 
 
479 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.46 
 
 
419 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.26 
 
 
447 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1256  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.84 
 
 
454 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  25.43 
 
 
451 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.65 
 
 
455 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  34.13 
 
 
446 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  27.89 
 
 
457 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  26.55 
 
 
458 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.14 
 
 
442 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1256  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.23 
 
 
452 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.68 
 
 
445 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  31.45 
 
 
468 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  29.77 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  28.98 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  30.84 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  26.91 
 
 
468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4063  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.24 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.91 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.06 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.24 
 
 
449 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1655  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.07 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.381128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>