More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1174 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  100 
 
 
286 aa  543  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  46.83 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.99 
 
 
286 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  42.51 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  42.51 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  41.43 
 
 
652 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  43.6 
 
 
290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  41.11 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  43.32 
 
 
286 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  41.03 
 
 
293 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  42.62 
 
 
306 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  41.05 
 
 
288 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
290 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
287 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
293 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
628 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
306 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
315 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
286 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.86 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  47.4 
 
 
628 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  42.11 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  41.11 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  43.9 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  44.1 
 
 
290 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
299 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  47.4 
 
 
630 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  39.87 
 
 
305 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  40.35 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  43.3 
 
 
642 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  44.76 
 
 
292 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
285 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
283 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  43 
 
 
305 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  46.71 
 
 
637 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  39.58 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.91 
 
 
286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  40.38 
 
 
289 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
303 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  40.7 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  41.22 
 
 
282 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  39.44 
 
 
289 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.67 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.79 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
311 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  39.8 
 
 
306 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
286 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  43.32 
 
 
300 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  48.43 
 
 
613 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
288 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  41.33 
 
 
306 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.85 
 
 
286 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.91 
 
 
286 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.91 
 
 
286 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
286 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.91 
 
 
286 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
290 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
306 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
296 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
296 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  43.89 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  43.89 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  40.28 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  41.86 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  41.75 
 
 
296 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  41.1 
 
 
306 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  41.33 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
289 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
315 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  39.31 
 
 
298 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
311 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  40.49 
 
 
286 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  45.51 
 
 
305 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  43.3 
 
 
626 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  46.34 
 
 
289 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  41.5 
 
 
301 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
304 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  41.2 
 
 
286 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
306 aa  168  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
306 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  41.26 
 
 
286 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
291 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
288 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  38.22 
 
 
315 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1438  ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  43.33 
 
 
306 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2557  ABC transporter permease  39.36 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
286 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  37.9 
 
 
315 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.687848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>