More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1884 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  48.62 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  49.17 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02846  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 227 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  39.22 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  37.64 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.2 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  36.22 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  34.31 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  38.69 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  29.47 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  41.56 
 
 		 686 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  35.39 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  31.43 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  31.68 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  40.37 
 
 		 688 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  39.63 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  37.74 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.94 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  28.5 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.25 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 686 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34.27 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  34.54 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  35.85 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  34.87 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  32.2 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  40.99 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  32.41 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  36.22 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  37.74 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  36.54 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  30 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  36.3 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  35.98 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  35.89 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  36.99 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  39.19 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  33 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.26 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.22 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  35.71 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  35.19 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  36.84 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  32.79 
 
 		 254 aa  85.1  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  34.59 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  34.57 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  38.75 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  36.62 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  34.62 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  35.09 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  36.31 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  38.79 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  36.67 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  35.39 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>