108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5334 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  57.02 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  50.75 
 
 		 266 aa  254  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  52.47 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  54.26 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  44.11 
 
 		 356 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  55.81 
 
 		 171 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  53.22 
 
 		 172 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  53.95 
 
 		 183 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  39.34 
 
 		 651 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  39.29 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  43.59 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  42.64 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  40.31 
 
 		 201 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  36.04 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  36.04 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  35.03 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  35.03 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  29.28 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.5 
 
 		 491 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.89 
 
 		 473 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.65 
 
 		 456 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.65 
 
 		 456 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 459 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.79 
 
 		 477 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.35 
 
 		 486 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.69 
 
 		 481 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.69 
 
 		 481 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  36 
 
 		 481 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.69 
 
 		 481 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.64 
 
 		 491 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.08 
 
 		 491 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.73 
 
 		 455 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.73 
 
 		 455 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.73 
 
 		 455 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.89 
 
 		 491 aa  89  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  29.72 
 
 		 220 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.11 
 
 		 458 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.21 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31.88 
 
 		 455 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 455 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.88 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 455 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.25 
 
 		 455 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.25 
 
 		 455 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.4 
 
 		 455 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.4 
 
 		 455 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.12 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.37 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.59 
 
 		 487 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  32.42 
 
 		 487 aa  79  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  41.86 
 
 		 543 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.57 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  56.82 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  26.77 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  27.16 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  45.68 
 
 		 904 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  26.87 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  64.29 
 
 		 561 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  63.16 
 
 		 1077 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  54.55 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  65.85 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  25.17 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  28.02 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.32 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.27 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  26.26 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  57.14 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 464 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.64 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  56.1 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  56.82 
 
 		 855 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28.29 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 192 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  24.75 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  26.42 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  26.42 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  29.77 
 
 		 483 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  29.01 
 
 		 483 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  45.24 
 
 		 803 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  24.77 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  27.27 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  25.76 
 
 		 400 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  50 
 
 		 521 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  26.57 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>