More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1438 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  59.31 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 430 aa  302  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  43 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 414 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 401 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  27.25 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  27.25 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.48 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.05 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.88 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.69 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.69 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.69 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.13 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  32.48 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.84 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 458 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.26 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.99 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.99 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.99 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.99 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.52 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.4 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  29.57 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.06 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.33 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.33 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.03 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.53 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.66 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.53 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  28.46 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>