More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0714 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.27 
 
 
259 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  63.24 
 
 
255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  65.48 
 
 
253 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  65.61 
 
 
256 aa  331  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 
271 aa  328  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  62.93 
 
 
255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  63.57 
 
 
259 aa  325  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 
256 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  58.98 
 
 
260 aa  316  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.85 
 
 
258 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.65 
 
 
254 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  62.55 
 
 
253 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  62.4 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  62.16 
 
 
253 aa  308  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  58.59 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.06 
 
 
279 aa  298  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  62.06 
 
 
253 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.32 
 
 
251 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  57.03 
 
 
263 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  57.71 
 
 
256 aa  294  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  58.3 
 
 
257 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  59.68 
 
 
253 aa  288  7e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  56.08 
 
 
262 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.66 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.73 
 
 
253 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  55.21 
 
 
257 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  56.13 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.52 
 
 
262 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.05 
 
 
263 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.05 
 
 
263 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54 
 
 
252 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.46 
 
 
246 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  50.78 
 
 
258 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.61 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  46.37 
 
 
280 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.74 
 
 
276 aa  229  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 
278 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  45.56 
 
 
283 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 
258 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.03 
 
 
268 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.53 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 
249 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
264 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.82 
 
 
247 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 
241 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 
266 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.18 
 
 
249 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.68 
 
 
259 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.49 
 
 
259 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 
272 aa  175  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 
258 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 
257 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 
248 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.86 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.86 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.95 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  35.78 
 
 
239 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  36.84 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.33 
 
 
263 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.2 
 
 
249 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 
246 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
236 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 
256 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.4 
 
 
250 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 
254 aa  168  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  36.63 
 
 
257 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  42.39 
 
 
264 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 
243 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  41.39 
 
 
259 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.84 
 
 
267 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.79 
 
 
251 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.69 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  35.62 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.77 
 
 
256 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.77 
 
 
256 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.48 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.26 
 
 
267 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.22 
 
 
237 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.91 
 
 
248 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
237 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>