More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3101 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  65.93 
 
 		 516 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  99.44 
 
 		 533 aa  1066    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  68.97 
 
 		 519 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  67.27 
 
 		 512 aa  663    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  67.27 
 
 		 512 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  72.78 
 
 		 508 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  75.1 
 
 		 514 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  75.49 
 
 		 511 aa  776    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  65.93 
 
 		 512 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  79.73 
 
 		 533 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  67.07 
 
 		 512 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  81.89 
 
 		 504 aa  823    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  71.96 
 
 		 524 aa  720    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  100 
 
 		 533 aa  1071    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  73.5 
 
 		 527 aa  725    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  70.22 
 
 		 509 aa  688    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  65.08 
 
 		 524 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  65.04 
 
 		 504 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  64.17 
 
 		 508 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  63.13 
 
 		 537 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  56.66 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  59.92 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  56.31 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  56.31 
 
 		 533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  55.51 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.27 
 
 		 530 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  50.58 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  54.67 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 517 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  53.32 
 
 		 517 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  53.56 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  52.34 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.22 
 
 		 523 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  49.22 
 
 		 522 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  49.22 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  52.42 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  47.12 
 
 		 522 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  51.76 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  50.58 
 
 		 546 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  49.04 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  50.52 
 
 		 567 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  50.5 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.51 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  52.64 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  51.66 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  47.41 
 
 		 522 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  47.28 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  50.68 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  50.68 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  50.2 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  50.98 
 
 		 506 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  49.41 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  48.91 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  49.71 
 
 		 534 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  46.37 
 
 		 539 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.7 
 
 		 511 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  42.72 
 
 		 534 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  37.45 
 
 		 514 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  42.64 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.94 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40.86 
 
 		 532 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  40.39 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.17 
 
 		 510 aa  353  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.12 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  36.73 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.66 
 
 		 513 aa  349  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  40.99 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  43.11 
 
 		 514 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  41 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.13 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.13 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 510 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.72 
 
 		 503 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  43.39 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.73 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  39.49 
 
 		 514 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.52 
 
 		 517 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 510 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 510 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  40 
 
 		 514 aa  342  8e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 		 510 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  41.56 
 
 		 527 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  36.74 
 
 		 507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  41.43 
 
 		 518 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>