233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1507 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 511 aa  1016    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  76.13 
 
 		 513 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  67.8 
 
 		 511 aa  618  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  55.93 
 
 		 517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  60.24 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  60.24 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  60.21 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  56.19 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  58.06 
 
 		 514 aa  538  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  56.31 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  56.52 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  55.71 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  55.46 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  55.46 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  48.3 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  48.66 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  49.18 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  47.94 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  48.34 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  46.23 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  46.86 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  45.72 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  48.58 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  45.24 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  37.85 
 
 		 504 aa  333  4e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  37.89 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  44.77 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  38.1 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  47.87 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  36.85 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  35.44 
 
 		 505 aa  323  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  36.4 
 
 		 505 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  42.36 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  43.26 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  38.4 
 
 		 512 aa  316  8e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  41.01 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  38.15 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  37.45 
 
 		 516 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  39.37 
 
 		 507 aa  294  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  35.59 
 
 		 505 aa  286  7e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  37.83 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.13 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  34.19 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  33.92 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.92 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 		 434 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.3 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.08 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.86 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.37 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.28 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.48 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.41 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33 
 
 		 429 aa  150  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.66 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  32.25 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  32.25 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  32.18 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.32 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.85 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  34.15 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.93 
 
 		 438 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.23 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0607  thymidine phosphorylase  33.16 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  31.86 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  32.24 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  31.88 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  31.09 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  33.01 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  32.51 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  32.02 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.87 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  32.92 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.25 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  31.37 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.15 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.5 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.15 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  35.19 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  34.77 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.3 
 
 		 433 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  27.85 
 
 		 432 aa  140  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.8 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  30.05 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.9 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.55 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.29 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.91 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.88 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.14 
 
 		 428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.55 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>