More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3457 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  98.03 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  48.77 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.56 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.22 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.93 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  47.76 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  44.08 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.91 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  44.71 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.55 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.03 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  44.35 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.62 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  43.43 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  44.72 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.93 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.77 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.9 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  46.94 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.9 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.63 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.86 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46.94 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.17 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  43.15 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  43.27 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.62 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.08 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  41.83 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.67 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.08 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.11 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  43.75 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  42.91 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  42 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  43.5 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  45.74 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.28 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.11 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  40.82 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.03 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  42.04 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.83 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  42.28 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.22 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.36 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  43.27 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  42.68 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.6 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  43.15 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.71 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  41.46 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  41.46 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  46.89 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.7 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.04 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.86 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.19 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  42.35 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  41.46 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  41.46 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  39.75 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  42.34 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.46 
 
 		 268 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.19 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  43.95 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.47 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  40.41 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.02 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  41.83 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.46 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  41.46 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>