More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1889 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  350  5e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  36.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  39.85 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.77 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  33.06 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  34.96 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.53 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.57 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  28.79 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.79 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>