More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1479 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  55.56 
 
 
197 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  50.53 
 
 
192 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.57 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  50.55 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.03 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.03 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  48.03 
 
 
198 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.03 
 
 
198 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.03 
 
 
198 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  50 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.37 
 
 
198 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  47.37 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  46.67 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.02 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  46.71 
 
 
198 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  44.62 
 
 
185 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  47.16 
 
 
184 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  47.53 
 
 
196 aa  124  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.86 
 
 
180 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.37 
 
 
199 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  44.81 
 
 
184 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.68 
 
 
207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  43.31 
 
 
207 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  45 
 
 
180 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.03 
 
 
207 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  44.81 
 
 
184 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  45.95 
 
 
184 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.39 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.3 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  41.21 
 
 
183 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  42.78 
 
 
186 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.89 
 
 
190 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.08 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.08 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.08 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  40.64 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  40 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.35 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.54 
 
 
189 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  39.56 
 
 
186 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  41.71 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  44.38 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  42.08 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  43.78 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  41.14 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  41.83 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.16 
 
 
207 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.94 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  45.1 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.5 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  37.3 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  40.99 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  37.3 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  45.1 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.01 
 
 
207 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  41.08 
 
 
198 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  41.3 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  39.89 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40.11 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.72 
 
 
185 aa  111  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  34.32 
 
 
210 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  39.89 
 
 
184 aa  111  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  42.86 
 
 
221 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  40.22 
 
 
187 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.48 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  41.58 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  41.29 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  41.88 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.26 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  40.31 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  42.46 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  36.17 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  38.92 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  38.62 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  38.83 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  41.29 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  38.83 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  38.83 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.94 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  30.48 
 
 
183 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  37.89 
 
 
186 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  45.36 
 
 
185 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  30.48 
 
 
186 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.34 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.88 
 
 
202 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>