More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3519 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
987 aa  2031    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
705 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
960 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1501 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
1131 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.54 
 
 
497 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
710 aa  238  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 
1651 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 
1631 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1342 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.62 
 
 
727 aa  222  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
1418 aa  220  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1478 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.33 
 
 
727 aa  218  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 
1646 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.81 
 
 
999 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
494 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1109 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
1273 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
1432 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  28.05 
 
 
956 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.11 
 
 
1081 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 
905 aa  195  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
620 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  26.17 
 
 
1182 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
998 aa  193  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
1118 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
1057 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
1013 aa  191  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
789 aa  190  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
887 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  27.29 
 
 
827 aa  189  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
767 aa  187  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
821 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 
1125 aa  182  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0066  histidine kinase  41.95 
 
 
395 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.126071  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  25.57 
 
 
1125 aa  181  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 
1344 aa  181  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
969 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
944 aa  178  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1068 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
779 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
830 aa  177  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
795 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
1171 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
636 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
492 aa  174  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
1171 aa  174  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  23.45 
 
 
931 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
759 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
699 aa  172  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
1009 aa  171  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1428 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 
733 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
721 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 
1122 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
1059 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
713 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
1124 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  28.25 
 
 
1560 aa  168  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
1076 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
689 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
838 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  44.81 
 
 
952 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
526 aa  166  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
962 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
1066 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1120 aa  164  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1433 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1297 aa  164  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 
1011 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
654 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
1654 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1084 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  26.76 
 
 
691 aa  161  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
1002 aa  161  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
943 aa  161  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
785 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
922 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
994 aa  160  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
678 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
806 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 
1224 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  29.54 
 
 
1417 aa  159  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
1000 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  26.15 
 
 
691 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
703 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  29.04 
 
 
1418 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
858 aa  156  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
664 aa  156  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.52 
 
 
771 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.87 
 
 
1561 aa  156  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 
1157 aa  155  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
682 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
941 aa  155  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>