More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2723 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 
967 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  46.13 
 
 
961 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.75 
 
 
934 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  43.89 
 
 
959 aa  802    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  37.88 
 
 
937 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.89 
 
 
936 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.75 
 
 
934 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  43.88 
 
 
944 aa  811    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  39.44 
 
 
914 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  42.78 
 
 
938 aa  760    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 
942 aa  804    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  42.57 
 
 
941 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.82 
 
 
967 aa  811    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  46.34 
 
 
967 aa  830    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.33 
 
 
923 aa  775    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 
941 aa  771    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  43.5 
 
 
940 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 
934 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.6 
 
 
936 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.99 
 
 
936 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  44.96 
 
 
943 aa  811    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  43.6 
 
 
960 aa  768    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  46.34 
 
 
955 aa  820    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.39 
 
 
937 aa  799    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  41.41 
 
 
955 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.71 
 
 
966 aa  761    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.08 
 
 
928 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 
936 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.68 
 
 
939 aa  700    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  45.62 
 
 
961 aa  819    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.43 
 
 
934 aa  991    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
955 aa  1974    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.15 
 
 
973 aa  903    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  37.39 
 
 
983 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  41.51 
 
 
949 aa  742    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  43.31 
 
 
951 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.33 
 
 
938 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 
934 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.67 
 
 
966 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 
934 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
942 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.3 
 
 
934 aa  733    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.4 
 
 
978 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.99 
 
 
959 aa  818    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  42.14 
 
 
938 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
934 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.12 
 
 
941 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.23 
 
 
934 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.09 
 
 
934 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  39.64 
 
 
934 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  39.77 
 
 
935 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.26 
 
 
992 aa  893    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.89 
 
 
943 aa  794    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  33.16 
 
 
923 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  32.83 
 
 
923 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.32 
 
 
1009 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.58 
 
 
973 aa  211  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.26 
 
 
991 aa  211  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.13 
 
 
1024 aa  210  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.9 
 
 
1035 aa  209  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.06 
 
 
997 aa  208  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  25.98 
 
 
1024 aa  208  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 
1015 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.9 
 
 
978 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 
987 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.18 
 
 
967 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.79 
 
 
977 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
1011 aa  200  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.67 
 
 
973 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  23.61 
 
 
984 aa  199  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.09 
 
 
906 aa  199  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 
1000 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.01 
 
 
1037 aa  197  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.04 
 
 
971 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.33 
 
 
1031 aa  197  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.11 
 
 
966 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 
976 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  23.32 
 
 
975 aa  195  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  24.84 
 
 
1013 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.2 
 
 
983 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  25.47 
 
 
952 aa  194  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 
997 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.36 
 
 
984 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 
1014 aa  189  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  25.61 
 
 
967 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  27.1 
 
 
974 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.86 
 
 
950 aa  187  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  25.08 
 
 
996 aa  187  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.56 
 
 
948 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.07 
 
 
976 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.71 
 
 
1025 aa  185  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.87 
 
 
976 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.02 
 
 
989 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.87 
 
 
1046 aa  183  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.02 
 
 
1055 aa  183  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.22 
 
 
999 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.15 
 
 
1034 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 
1022 aa  183  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  25.48 
 
 
1043 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  25.46 
 
 
894 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>